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XXXII Congreso Nacional de la Sociedad Española de Trombosis y Hemostasia
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Financiación: Asociación Madrileña de Hematología y He-
moterapia (AMHH) y programa de Proyectos de Investigación
Traslacional del CIBERER.
Leucemias agudas
SP-002
Metaanálisis de las anomalías
citogenéticas crípticas en pacientes
con leucemia mieloide aguda
de novo
con
cariotipo normal
Ibáñez M. (1), Martínez-Rubio M.ª D. (2), Such E. (1), Onecha E. (3),
Goméz-Seguí I. (1), Sellés J. (2), Company D. (1), Barragán E. (4),
Ayala R. (3), LLop M. (4), López-Pavía M. (5), Neef A. (1), Martínez-
López J. (3), Raspado I. (3), De Matteo B. (1), Esteban J. (1),
Carretero C. (1), Martínez F. (1), Hernani R. (1), Andreu R. (1),
Senent L. (1), Montesinos P. (1), Sanz M. (1), Cervera J. (6)
(1) Servicio de Hematología, (4) Departamento de Patología Médica y (6) Unidad
de Genética. Hospital Universitario y Politécnico La Fe. Valencia. (2) Servicio de
Arrays. Unidad de Genómica. Instituto de Investigación Sanitaria La Fe. Valencia.
(3) Hospital Universitario 12 de Octubre. Madrid. (5) Servicio de Hematología.
Hospital General de Valencia. Valencia
Introducción:
Aproximadamente el 50% de los pacientes
con leucemia mieloide aguda (LMA) no presenta alteraciones
recurrentes por técnicas citogenéticas convencionales. Es posible
realizar el estudio de variaciones en el número de copias (CNV)
y pérdidas de heterocigosidad (LOH) mediante la tecnología de
arrays de SNP (SNP-A). El estudio en paralelo de tejido sano
permite discriminar las alteraciones adquiridas de aquellas con
un carácter polimórfico.
Objetivos:
Identificar mediante SNP-A la frecuencia de ano-
malías citogenéticas crípticas adquiridas en 225 pacientes con
LMA
de novo
y cariotipo normal (CN).
Métodos:
Se estudiaron muestras pareadas (somática/germi-
nal) de 44 LMA-CN
de
novo
(32 del Hospital Universitario y
Politécnico La Fe y 12 del Hospital Universitario 12 de Octubre.
El estudio se amplió con 181 casos procedentes de repositorios
públicos [n = 49 TCGA
1
, n = 53, Kronke y cols.
2
; n = 30 Tadayu-
ki y cols.
3
; y n = 49 Koren-Michowitz y cols.
4
]. Se emplearon
arrays de alta densidad Genome-Wide Human SNP 6.0 (n = 181)
y Cytoscan HD (n = 44) (Affymetrix, Santa Clara, CA). El análi-
sis pareado se hizo con el programa Chromosome Analysis Sui-
te
®
con el genoma de referencia GRCh33/hg19. Los criterios de
detección para CNV fueron un mínimo de 20 sondas en 100 kb
y para LOH, 100 sondas en 5.000 kb. Las alteraciones en la línea
germinal se excluyeron del análisis mediante inspección visual y
por comparación con las variaciones polimórficas reportadas en
la Database of Genomic Variants. Las muestras fueron proporcio-
nadas por el Biobanco La Fe.
El estudio se amplió con 181 casos procedentes de reposito-
rios públicos [n = 49 TCGA (1), n = 53 Kronke y cols. (2), n = 30
Tadayuki y cols. (3) y n = 49 Koren-Michowitz y cols. (4)].
Resultados:
En nuestra cohorte, el 57% (n = 25) de los pa-
cientes presentó alteraciones crípticas, (2,32 alteraciones/pa
(1-10). Las alteraciones se concentraron en los cr. 1 (n = 9); 11q
(n = 8), 7q (n = 6) y 13q (n = 5)
(Figura 1)
. Asimismo, las altera-
ciones implicaron a genes como
KMT2A, FLT3, ETV6, RUNX1
y HNPKR
.
Del metaanálisis se detectaron un total de 304 anomalías críp-
ticas en el cariotipo, 151 deleciones, 99 ganancias y 54 CN-LOH
en el 67% de los pa. (n = 143). Los cr. más afectados fueron 1, 2,
5, 6, 7, 11, 13, 16 y 19. El mayor número de LOH se observó en
13q (involucrando a
FLT3),
1p y 7p. En 19p se detectaron más
deleciones, mientras que en los cr. 1, 4, 5 y 20 más inserciones.
Respecto al pronóstico, ni la presencia de alteraciones crípticas
ni el número de ellas mostraron un impacto significativo en la
supervivencia global de los pacientes LMA-CN, incluso cuando
se estratificaron en base a las mutaciones en
FLT3-
ITD.
Conclusiones:
El 67% de los pacientes con LMA-CN pre-
sentó anomalías citogenéticas adicionales que no fueron detec-
tables en el cariotipo convencional. La presencia de alteraciones
crípticas no tuvo un impacto en el resultado de los pacientes, in-
cluso cuando los pacientes se estratificaron en base al número de
alteraciones o a la presencia de mutaciones en FLT3-ITD.
Financiación: Estudio financiado por Fundación Española de
Hematología (FEHH), PI12/01047, RD12/0036/0014, PIE13/00046,
PI13/01640, PI13/02837, PT13/0010/0026, PI14/01649 y PROME-
TEOII/2015/025.
Tabla 2.
Distribución de pacientes según grupo
Total
(n)
Analizados
(n)
Diagnóstico
(n)
Fallo medular inclasificable
20
11
4
Fallo medular clasificado
46
37
25
Anemia de Blackfan-Diamond 11
11
9
Anemia de Fanconi
4
3
3
Neutropenia congénita
6
6
2
Trombopenia congénita
17
15
10
Schwachman-Diamond
3
1
1
Mielodisplasia hereditaria
1
1
0
Disqueratosis congénita
4
0
0
Figura 1.
Anomalías citogenéticas crípticas en la cohorte independiente de
44 pacientes con LMA-CN
de novo
. Las pérdidas se representan en rojo,
las ganancias en azul y las LOH en morado.